Statutairement, le Conseil syndical est élu (scrutin de liste) pour une durée de trois ans par l'Assemblée générale, à la majorité des suffrages exprimés et comporte au plus 20 membres.

Il se réunit au moins 2 fois par an sur convocation du Président ou à défaut du Secrétaire général. Le Conseil gère le Syndicat dans le cadre des orientations adoptées en Assemblée générale et élit en son sein le Bureau exécutif. Le Conseil syndical élu lors de l'Assemblée générale du 9 octobre 2020 se compose des personnes suivantes :

Sandrine CLOTEAUX (Chimie)	Isabelle BLANC (Chimie)	Maxime KOSAROWYCZ Chimie)	Alexandra SCHVENT (Chimie)
Hocine NAÏT BELKACEM (Chimie)	Bertrand LION (Chimie)	Laurent VALETTE (Chimie)	Marie-Christine FRANCOIS (Chimie)
Stéphanie CARCONE (Industrie pharmaceutique)	Ahmed TIGHIOUARET (Industrie pharmaceutique)	Isabelle TRIDON (Industrie pharmaceutique)	Thierry LECHOPIED (Industrie pharmaceutique)
Bruno DEVOUGE (Industrie pharmaceutique)	Albert MSIHID (Verre mécanique)	Hervé VINCENT (Caoutchouc)	Jean Philippe FAUVET (Plasturgie)
Roger HALEGOUET Officine	Gérard PIPAT Répartition pharmaceutique	Jean Pierre VASEK Union